Para configurar o Adobe InDesign para o envio de arquivos em PDF/X1-a, siga as instruções. 
Vá até o menu ''File'' e em''Adobe PDF Presets'', selecione "PDF/X-1a:2001".Clique em Salvar.

Na Aba General deixe como a figura abaixo.

Na Aba Compression configure conforme a imagem abaixo:

Na Aba Output, em ''Color'' selecione em ''Destination'' a opção: " U.S. Web Coated (SWOP) v2"

Clique em "Save Preset..." para salvar as definições, salve com o nome que desejar.

Pronto, agora o seu Adobe InDesign está configurado para publicar o PDF/X1-a de acordo com o nosso padrão.